大规模人群研究：血液DNA病毒组与自身免疫性疾病和COVID-19相关

致病性病毒引起的异常免疫反应会导致疾病的发生发展，但目前我们对由人类病毒组中病毒引起的病理性免疫反应的理解仍然有限，尤其是在大规模人群水平上。大约1%的人携带内源性疱疹病毒6型（eHHV-6），在超过8%的健康人的血液中可检测到环状病毒，这些病毒可以被表征为人类“病毒组”。目前尚不明确哪些自身免疫性疾病与病毒感染有关，以及哪些因素使病毒感染导致和加剧自身免疫性疾病。

本研究旨在探讨特定人类病毒的存在与疾病或免疫反应之间的关系。研究分析了6,321名日本个体的全基因组测序数据，包括银屑病、类风湿性关节炎（RA）、系统性红斑狼疮（SLE）、肺泡蛋白质沉积症（PAP）或多发性硬化等自身免疫性疾病患者、2019冠状病毒病（COVID-19）患者以及健康对照者。研究系统地量化了血液DNA病毒组的两种成分，即eHHV-6和环状病毒，并进行了病例-对照关联研究（图1）。

图1 研究设计

研究发现，eHHV-6B阳性的受试者患SLE和PAP的风险更高；eHHV-6B阳性与高SLE疾病活动指数评分之间存在强相关性；全基因组关联研究（GWAS）和长读长测序将HHV-6B基因组的整合定位到22号染色体的一个位点；表位映射和单细胞RNA测序表明，eHHV-6B在SLE患者中具有独特的免疫诱导作用；此外，高环状病毒载量与SLE、RA和COVID-19状态密切相关。

本研究揭示了人类病毒组与自身免疫性疾病和感染性疾病之间的相关性。尽管只有少数个体携带eHHV-6或高载量的环状病毒，但其阳性结果似乎对疾病风险和临床表型有显著影响，尤其是与疾病既往已确定的遗传和环境因素相比。这表明，在个体病毒组中存在的这些病毒可能是具有潜在临床价值的生物标志物，有助于采取个性化医疗方法预防疾病。